Der Sinn einer Wurzelkanalbehandlung liegt in einem bakteriendichten Verschluss des Zahns nach "oben und unten", also an der Wurzelspitze und zur Mundhöhle hin. Bei starker Keimbesiedlung in den Wurzelkanälen von nervtoten Zähnen lassen sich mit dem Laser häufig auch sonst schwer behandelbare Zähne therapieren.

Das Wurzelkanalsystem ist im unter Drittel einer Zahnwurzel sehr verzweigt. Dabei sind die Verästelungen so fein, dass chemisch physikalische Lösungen nicht alle bakterienbesiedelten und entzündeten Bereiche erreichen können. 

Das Licht des Lasers dringt viel weiter ins Kanalsystem vor und kann deshalb nahezu alle Bakterien abtöten.